H. L. Hunley tar sitt skepp, H. L. Hunley, ut i Charleston, South Carolina harbor och det sjunker med alla händer. När blockaden fortfarande behöver brytas, har brigadgeneral P. G. T. Beauregard fartyget uppvuxet och sätter George E. Dixon i laddning. Han börjar leta efter en besättning och efter vissa svårigheter slutligen finner tillräckligt frivilliga att bemanna det. De övar på att vrida propellern. Besättningen kommer inte alla överens med varandra., Dixon blinkar tillbaka till slaget vid Shiloh, där ett guldmynt som gavs till honom av sin fru (som senare dödades i en ångbåt explosion orsakad av en drivande gruva) avböjde en kula och räddade sitt liv. De tar ner skeppet och sitter på botten för att se hur länge de kan stanna ner och nästan fastna. USA: s flotta varnas om ubåten. Besättningen röstar att om de efter en attack fastnar på botten, öppnar de ventilerna, översvämmar skeppet, snarare än kväver. De går ut för att attackera USS Wabash, men attacken misslyckas., Efter varningen har fartyget draperat metallkedjenät över sidan. Även repet som var fäst vid torpeden de skulle släppa under skeppet blir lös och blir intrasslad i propellern. Det måste skäras loss medan sjömän på Wabash skjuta på Hunley. Beauregard föreslår att torpeden sätts i slutet av en lång spar. USS Housatonic beordras att ändra sin position i hamnen och alltid vara redo att ånga, vilket innebär att det inte kan hänga metallnät över sidan. Hunleys andre befälhavare, löjtnant., Alexander, beordras att Mobile, Alabama, och en ung soldat som hade varit volontärarbete att gå med i besättningen får göra det.
den 17 februari 1864 seglar CSS H. L. Hunley ut och attackerar USS Housatonic. Torpeden rammade in i skeppets sida. Det blåser upp och Housatonic är det första skeppet som någonsin sjunkit av en ubåt. En kula från skeppet bryter ett fönster i conning tower och sår Dixon. Explosionen öppnar sömmarna på Hunley och det tar på vatten. Det lägger sig till botten och besättningen kan inte släppa ballasten eller pumpa skeppet., Som överenskommet öppnar besättningen ventilerna och skeppet översvämningar och dödar hela besättningen. General Beauregard deltar i en minnesstund i Charleston för Hunley och hennes besättning, medan inne i den översvämmade ubåten, Dixon ser en vision av sin fru, välkomna honom in i livet efter detta.