websitefacebook
vårt projekt
Mountain lions (Puma concolor) var en gång utbredd i Nordamerika men deras sortiment krympte dramatiskt på grund av jakt av jordbrukare för att skydda boskap och habitat fragmentering. En gång vanligt i Pennsylvania har bergslejon varit nästan obefintlig sedan början av 1800-talet. den sista dokumenterade observationen av ett bergslejon i Pennsylvania var 1874., Den nordöstra USA befolkningen tros ha varit regionalt utdöd sedan 1930-talet; den senast inspelade iakttagelsen var i Maine 1938.
målet med vårt projekt är att sekvensera och analysera mitokondriella DNA-genom av ”Nittany Lions” – utdöda bergslejon från Pennsylvania och nordöstra USA-med hjälp av det gamla DNA-laboratoriet vid Penn State och banbrytande genomsekvenseringsteknik. Mitokondriellt DNA, eller mtDNA, är DNA ärvt från endast mamman.
västra USA Mountain lion. Foto: Mikaela Arnold.,
Vi har redan samlat in, eller har tillstånd att samla in, hudprover från flera taxidermied mountain lions från denna region, inklusive individen som visas på Penn State All Sports Museum! Vi kommer att sekvensera mtDNA genomet för varje individ, och sedan jämföra dessa sekvenser till dem från överlevande västra USA mountain lions och Florida panthers för att avgöra hur dessa olika populationer var relaterade.,
sammantaget hoppas vi att de uppgifter vi får kommer att vara till nytta för bevarandeinsatser avseende överlevande bergslejonpopulationer, för att öka medvetenheten om bevarande och utrotningsrisk bland dem i Penn State community – för vilken Nittany Lion är vår älskade maskot!, och för att lyfta fram medverkan av studenter i forskning på Penn State (detta projekt leds av studenter!).
Bruce Wright, New Brunswick wildlife biologist och författare, med vad som tros vara den sista östra puma., Puma var fångade av Rosarie Morin St Zacharie, Quebec i Somerset County Maine 1938. Monterat exemplar bor i New Brunswick Museum i St. John, New Brunswick (artighet av USFWS).
hur du kan hjälpa
du kan hjälpa oss att slutföra projektet genom att donera till vår crowdfunding-kampanj. Vårt mål är att höja $ 12,000 för att täcka kostnaden för laboratorietillbehör, mtDNA-sekvensering och grundstudentlöner., Om vi lyckas gå utöver detta mål, kommer eventuella ytterligare medel anskaffas tillämpas på efterföljande ansträngningar för att sekvensera kompletta nukleära genom (DNA ärvs från både mor och Far) av Nittany lejon. Donationer är avdragsgilla.
intervall för västra USA Mountain lion (brun, från Texas till längre västerut) och Florida panther (brun, begränsat område i Florida), och senaste Mountain lion observationer utanför dessa intervall på grund av migreringar (röda prickar). Den ursprungliga befolkningen av Mountain lions i Pennsylvania och nordöstra USA är utdöd., Bildkälla: National Geographic. Besök Mountain Lion Foundation och Felidae Conservation Fund för mer information om bevarande insatser för mountain lions och andra vilda katter och Vilda djur för Alla Kapitalförsäkringar Stiftelsen för information om bevarandet av vilda djur i Pennsylvania.
vår projektplan
som bergslejon har regionalt utrotats så länge, DNA från våra prover anses ”gamla DNA.,”Forntida DNA är mycket bräckligt och kan endast återvinnas i endast låga mängder, vilket kräver mer känsliga tekniker än vad som används med modernt DNA och ett högspecialiserat rent labb för bearbetning, som vi har på Penn State.
vi kommer att använda en banbrytande ”DNA capture” teknik för att specifikt rikta Mountain lion mtDNA sekvenser för vår analys. Efter DNA-fångst kommer proverna att sekvenseras med hjälp av Illumina HiSeq massivt parallellt sekvenseringsinstrument vid Penn State Huck Institutes of the Life Sciences Genomics Core Laboratory., Detta är en ganska dyr process som kommer att ta upp majoriteten av budgeten.
Dorman Panther, tros vara den sista bergslejon i Centre County, PA tills dess död 1856; artighet av ekologi lab I Science Hall på Albright College.
den ursprungliga Nittany Lion, dödad av Samuel Brush i Susquehanna County 1856; artighet av Penn State ’ s All Sports Museum.,
en Pennsylvania Mountain lion visas i Lycoming County Historical Society och Taber Museum i Williamsport, som kan ha skjutits nära Loyalsock River strax norr om Williamsport.,
vårt labb
vi är ett tvärvetenskapligt team av forskare baserade i avdelningarna för Antropologi och Biologi av Penn State University, men även studenter med majors i biokemi& molekylärbiologi, vilda djur& Fiskevetenskap, ekologi, immunologi& infektionssjukdom, och statistik. Vårt labb studerar evolutionär ekologi och bevarandebiologi, för många olika arter. För mer information, besök vår lab webbplats: Anthropological Genomics Laboratory webbplats.,
det gamla DNA-laboratoriet vid Penn State är en dedikerad renrumsanläggning där vi extraherar och sekvenserar DNA från skelettrester av utdöda arter eller från utdöda populationer av fortfarande överlevande arter, med samma metoder som nyligen har använts för att sekvensera generna av Neandertaler, mammutar och andra utdöda arter.
labbanläggningen där det gamla DNA-arbetet utförs är helt isolerad från annan DNA-forskning., Vi använder renrumspraxis hela tiden, inklusive användning av personlig skyddsutrustning för hela kroppen och ett riktningsflöde av arbete (dvs personal reser bara från det rena labbet till en byggnad där modernt DNA-arbete utförs, aldrig omvänd).
pågående projekt i labbet inkluderar genomisk analys av förhistoriska mänskliga individer från Amerika och av utdöda, jätte lemurer från Madagaskar!, I själva verket har vi nyligen publicerat ett papper på mtDNA genomsekvenser av flera utdöda lemur arter, inklusive populationer av två arter, med hjälp av metoder som är identiska med dem som vi kommer att använda för att sekvensera Nittany Lion genom: publicerade subfossil lemur gamla DNA-papper.
tack!
vi är mycket tacksamma för Ert intresse för vårt projekt och ert stöd. Alla storlekar donation är hjälpsam och uppskattad! Alla individer som donerar $ 100 eller mer kommer att inbjudas att delta i en föreläsning om forntida DNA-forskning på Penn State, inklusive Nittany Lion-projektet, och för att träffa vårt team., Individer som donerar $ 500 eller mer kommer också att nämnas med namn i bekräftelserna av det vetenskapliga papper vi publicerar baserat på detta arbete! Dessa tokens av uppskattning har inget monetärt värde och påverkar inte den avdragsgilla statusen för din donation.
eventuella ytterligare medel som tas upp utöver vårt mål kommer att tillämpas på efterföljande ansträngningar för att sekvensera de fullständiga kärnvapengenomen från Nittany Lions, nästa fas av vårt projekt. Det nukleära genomet är mycket större än mtDNA genomet och innehåller genetiskt material som ärvs från både mor och far., Information från den första fasen av projektet är nödvändig för att uppskatta budgeten för nukleär genomsekvensering, men detta kommer sannolikt att kosta $ 50,000 eller mer.
glöm inte…
kontrollera med din arbetsgivare för att se om de matchar välgörenhetsgivande. Ert stöd av vår kampanj är en avdragsgill gåva. Gå hit för att se om ditt företag matchar bidrag. Låt sedan vårt team veta matchförhållandet och ditt donationsbelopp efter att du har slutfört din donation, och vi kommer att uppdatera din gåva och vår kampanj totalt.