Planen av Ayala
Madero ble valgt til president i November 1911, og Zapata møtte ham igjen, men uten å lykkes. Med hjelp av en lærer, Otilio Montaño, Zapata utarbeidet Plan for Ayala, som erklærte Madero ute av stand til å oppfylle målene for revolusjonen. Underskriverne fornyet revolusjonen og lovet å oppnevne en midlertidig president fram til det kan være valg., De har også lovet å returnere den stjålne land til ejidos ved å ekspropriere, med betaling, en tredjedel av området av haciendas; de haciendas som nektet å akseptere denne planen ville ha sitt eget land ekspropriert uten kompensasjon. Zapata vedtatt slagordet «Tierra y Libertad» («Jord og Frihet»).
I løpet av sine kampanjer, Zapata fordelt lander tatt fra haciendas, som han ofte brent uten kompensasjon. Han er ofte bestilt henrettelser og expropriations, og hans krefter ikke alltid overholde lovene av krigen. Men under sin pittoreske utseende—hengende bart, kalde øyne, store sombrero—var en lidenskapelig mann med enkle idealer som han prøvde å sette ut i praksis. Den Zapatistas unngås kamp ved å vedta gerilja-taktikk., De drev sitt land med rifler på sine skuldre, gikk da kalt til å kjempe, og returnert til sine ploger på slutten av en kamp eller trefning. Noen ganger Zapata samlet tusenvis av menn; han har betalt dem ved å pålegge avgifter på provinsielle byer og extorting fra de rike. Armene ble tatt fra føderale tropper.
Når Generasjon Victoriano Huerta avsatt og drept Madero i februar 1913, Zapata og hans menn kom til utkanten av Mexico City og avvist Huerta tilbud for å forene seg med ham., Dette forhindret Huerta fra å sende alle sine tropper mot geriljaen i nord, som, under ledelse av en moderat politiker, Venustiano Carranza, hadde organisert den Constitutionalist Hær å beseire de nye diktator. Huerta ble tvunget til å forlate landet i juli 1914.
Zapata visste at Carranza er Constitutionalists fryktet ham. Han tiltrakk seg noen intellektuelle fra Mexico City, blant dem Antonio Díaz Soto y Gama, som ble hans teoretiker og senere etablert en bøndene partiet., Når Huerta falt, Zapata inviterte Constitutionalists til å akseptere hans Plan for Ayala og advarte dem om at han ville fortsette å kjempe uavhengig før planen ble satt til praktisk bruk.
I oktober 1914 Carranza kalles en sammenstilling av alle revolusjonære krefter. Pancho Villa, som ledet den viktigste delen av hæren i nord, og nektet å delta i møtet, fordi han mente Mexico City som fienden bakken. Forsamlingen ble flyttet til Aguascalientes, der både Villistas og Zapatistas deltok., Disse to gruppene utgjorde et flertall, og konvensjonen ble enige om å utnevne Generasjon Eulalio Gutiérrez som midlertidig president. Carranza avvist denne beslutningen, og marsjerte med hans regjering til Veracruz.
Krig brøt ut mellom de moderate (Carrancistas) og de revolusjonære (Conventionists). November 24 Zapata bestilt hans hær (nå kalt frigjøringshær på Sør-og nummerering 25 000 menn) til å okkupere Mexico City., Folk i hovedstaden sett i forbauselse da bøndene gikk fra dør til dør og ydmykt ber om mat og drikke, i stedet for å angripe palasser og krenker kvinner.
To uker senere Zapata og Villa møtte i utkanten av hovedstaden og deretter besøkte National Palace. De to lederne lovet å kjempe sammen før de satte en sivil president i palasset, og Villa akseptert Planen av Ayala.