websitefacebook
ons Project
Mountain lions (Puma concolor) waren ooit wijdverspreid in Noord-Amerika, maar hun verspreidingsgebied kromp drastisch door de jacht door boeren om vee en habitatfragmentatie te beschermen. Ooit gebruikelijk in Pennsylvania, zijn bergleeuwen bijna onbestaand sinds de vroege jaren 1800. de laatste gedocumenteerde waarneming van een bergleeuw in Pennsylvania was in 1874., De bevolking in het noordoosten van de VS is vermoedelijk sinds de jaren 1930 regionaal uitgestorven; de laatste waarneming was in Maine in 1938.het doel van ons project is het sequencen en analyseren van mitochondriaal DNA genomen van “Nittany Lions” — uitgestorven bergleeuwen uit Pennsylvania en het noordoosten van de VS — met behulp van het oude DNA laboratorium van Penn State en geavanceerde genoom sequencing technologie. Mitochondriaal DNA, of mtDNA, is DNA geërfd van alleen de moeder.
Western USA mountain lion. Foto met dank aan Karen Arnold.,
we hebben al huidmonsters verzameld van meerdere opgezette bergleeuwen uit deze regio, inclusief de persoon die te zien is in het Penn State All Sports Museum! We zullen het mtDNA genoom sequencen voor elk individu, en dan vergelijken deze sequenties met die van overlevende westerse Amerikaanse bergleeuwen en Florida panters om te bepalen hoe deze verschillende populaties gerelateerd waren.,over het algemeen hopen we dat de gegevens die we verkrijgen van nut zullen zijn voor het behoud van de overlevende bergleeuwpopulaties, om het bewustzijn over het behoud en het uitsterven risico te verhogen onder degenen in de Penn State community – waarvoor de Nittany Lion onze geliefde mascotte is!, en om de betrokkenheid van undergraduate studenten in onderzoek aan Penn State benadrukken (dit project wordt geleid door undergraduate studenten!).
Bruce Wright, natuurbioloog en auteur van New Brunswick, met vermoedelijk de laatste oostelijke puma., De puma werd gevangen door Rosarie Morin van St. Zacharie, Quebec in Somerset County, Maine in 1938. Het exemplaar bevindt zich in het New Brunswick Museum in St.John, New Brunswick (met dank aan USFWS).
hoe u kunt helpen
u kunt ons helpen dit project te voltooien door te doneren aan onze crowdfunding campagne. Ons doel is om $12.000 te verhogen om de kosten van laboratoriumbenodigdheden te dekken, mtDNA sequencing, en undergraduate student lonen., Als we erin slagen om verder te gaan dan dit doel, zullen eventuele extra fondsen worden gebruikt voor verdere inspanningen om complete nucleaire genomen (DNA geërfd van zowel de moeder als de vader) van Nittany Lions te sequencen. Donaties zijn fiscaal aftrekbaar.
Ranges of the western USA mountain lion (brown, from Texas to further west) and Florida panther (brown, restricted range in Florida), and recent mountain lion sightings Out of these ranges due to migrations (red dots). De oorspronkelijke populatie van bergleeuwen in Pennsylvania en het noordoosten van de VS is uitgestorven., Bron van de afbeelding: National Geographic. Bezoek de Mountain Lion Foundation en het Felidae Conservation Fund voor meer informatie over het behoud van bergleeuwen en andere wilde katten, en de Wildlife for Everyone Endowment Foundation voor informatie over wildlife conservation in Pennsylvania.
ons projectplan
aangezien bergleeuwen al zo lang regionaal uitgestorven zijn, wordt het DNA van onze monsters beschouwd als ” oud DNA.,”Oeroud DNA is erg fragiel en kan alleen in kleine hoeveelheden worden teruggewonnen, waardoor gevoeliger technieken nodig zijn dan bij modern DNA en een zeer gespecialiseerd schoon lab voor verwerking, dat we bij Penn State hebben.
We zullen een geavanceerde “DNA capture” techniek gebruiken om mtDNA sequenties van mountain lion specifiek aan te pakken voor onze Analyse. Na het vastleggen van DNA, zullen de monsters worden gesequenced met behulp van het Illumina HiSeq massaal parallel sequencing instrument in de Penn State Huck Instituten van de Life Sciences Genomics Core Laboratory., Dit is een vrij duur proces dat het grootste deel van de begroting zal vergen.
De Dorman Panther, vermoedelijk de laatste bergleeuw in Centre County, PA tot zijn dood in 1856; met dank aan het Ecology lab in Science Hall van het Albright College.
De originele Nittany Leeuw, gedood door Samuel Brush van Susquehanna County in 1856; met dank aan Penn State ‘ s All Sports Museum.,
een bergleeuw uit Pennsylvania die te zien is in de Lycoming County Historical Society and Taber Museum in Williamsport, die mogelijk is neergeschoten nabij de Loyalsock River net ten noorden van Williamsport.,
Ons Lab
We zijn een interdisciplinair team van onderzoekers op basis van in de Afdelingen van de Antropologie en de Biologie van Penn State University, maar ook voor studenten met majors in de Biochemie & Moleculaire Biologie, Natuur & Visserij Wetenschap, Ecologie, Immunologie & Besmettelijke Ziekte, en Statistieken. Ons lab bestudeert evolutionaire ecologie en conservatiebiologie, voor veel verschillende soorten. Voor meer informatie, bezoek onze lab website: Anthropological Genomics Laboratory website.,
Het ancient DNA laboratory in Penn State is een speciale cleanroom faciliteit waarin we DNA extraheren en sequencen uit de skelet resten van uitgestorven soorten of uit uitgestorven populaties van nog overlevende soorten, met behulp van dezelfde methoden die onlangs zijn gebruikt om de sequentie van de genomen van Neandertalen, mammoeten en andere uitgestorven soorten.
De laboratoriumfaciliteit waarin het oude DNA-werk wordt gedaan, is volledig geïsoleerd van ander DNA-onderzoek., We gebruiken te allen tijde cleanroompraktijken, inclusief het gebruik van persoonlijke beschermingsmiddelen voor het hele lichaam en een gerichte werkstroom (d.w.z. personeel reist alleen van het clean lab naar een gebouw waar modern DNA-werk wordt uitgevoerd, nooit omgekeerd).
lopende projecten in het lab omvatten genomische analyse van prehistorische menselijke individuen uit Amerika en van uitgestorven reuzenmaki ‘ s uit Madagaskar!, In feite hebben we onlangs een artikel gepubliceerd over de mtDNA-genoomsequenties van meerdere uitgestorven lemurensoorten, inclusief populaties van twee soorten, met behulp van methoden die identiek zijn aan die welke we zullen gebruiken om de Nittany Lion genomen te sequencen:gepubliceerd subfossil lemur ancient DNA paper.
Dank u!
we zijn u zeer dankbaar voor uw interesse in ons project en uw steun. Elke grootte donatie is nuttig en gewaardeerd! Alle personen die $100 of meer doneren worden uitgenodigd om een lezing bij te wonen over het oude DNA-onderzoek op Penn State inclusief het Nittany Lion project, en om ons team te ontmoeten., Personen die $500 of meer doneren, worden ook bij naam genoemd in de dankbetuigingen van het wetenschappelijk artikel dat we publiceren op basis van dit werk! Deze tokens van waardering hebben geen monetaire waarde en hebben geen invloed op de fiscaal aftrekbare status van uw donatie.
eventuele extra middelen die buiten ons doel worden verzameld, zullen worden gebruikt voor verdere inspanningen om het volledige nucleaire genomen van Nittany Lions, de volgende fase van ons project, te sequencen. Het nucleaire genoom is veel groter dan het mtDNA-genoom en bevat genetisch materiaal dat van zowel de moeder als de vader wordt geërfd., Informatie uit de eerste fase van het project is nodig om het budget voor de sequencing van het nucleaire genoom te schatten, maar dit zal waarschijnlijk $50.000 of meer kosten.
niet vergeten…
neem contact op met uw werkgever om te zien of ze overeenkomen met liefdadigheid geven. Uw steun aan onze campagne is een fiscaal aftrekbaar geschenk. Ga hier om te zien of uw bedrijf overeenkomt met bijdragen. Laat ons team dan de wedstrijdverhouding en het bedrag van uw donatie weten nadat u uw donatie hebt voltooid, en wij zullen uw gift en het totaal van onze campagne bijwerken.