websitefacebook
Vårt Prosjekt
Mountain lions (Puma concolor) en gang var utbredt i hele Nord-Amerika, men deres utvalg krympet dramatisk på grunn av fangst av bønder til å beskytte husdyr og habitat fragmentering. Når vanlig i Pennsylvania, mountain lions har vært nesten ikke-eksisterende siden tidlig på 1800-tallet. Siste dokumenterte observasjon av en mountain lion i Pennsylvania ble i 1874., Det Nordøstlige USA befolkning er antatt å ha vært regionalt utdødd siden 1930-tallet; den siste sighting var i Maine i 1938.
målet for vårt prosjekt er å sekvens og analysere mitokondrie DNA i genomet til «Nittany Lions» — utdødd mountain lions fra Pennsylvania, og den Nordøstlige USA-ved hjelp av den Gamle DNA-laboratoriet ved Penn State, og cutting-edge genom sekvensering teknologi. Mitokondrie-DNA eller mtDNA, er DNA arves kun fra mor.
Vestlige USA mountain lion. Foto: Karen Arnold.,
Vi har allerede samlet inn, eller ha tillatelse til å samle inn, hud prøver fra flere taxidermied mountain lions fra denne regionen, inkludert den enkelte utstilt på Penn State Alle Idretter Museum! Vi vil sekvens mtDNA genom for hver enkelt, og deretter sammenligne disse sekvensene til de overlevende fra Vestlige USA mountain lions og Florida panthers i for å finne ut hvordan disse ulike populasjoner var i slekt.,
Totalt er vi håper de data vi mottar vil være for bruk til bevaring innsats om å overleve mountain lion bestander, for å øke bevisstheten om bevaring og utryddelse risiko blant de i Penn State community – som Nittany Lion er vår kjære maskot! og for å markere involvering av lavere grads studenter i forskning på Penn State (dette prosjektet er ledet av lavere grads studenter!).
Bruce Wright, New Brunswick, dyreliv biolog og forfatter, med hva som antas å være den siste øst-puma., Puma ble fanget av Rosarie Morin av St. Zacharie, Quebec i Somerset County Maine i 1938. Montert prøven ligger i New Brunswick Museum i St. John, New Brunswick (gjengitt med tillatelse av USFWS).
Hvordan du kan hjelpe
kan Du hjelpe oss med å fullføre dette prosjektet ved å donere et beløp til vår crowdfunding-kampanje. Vårt mål er å høyne med $12,000 til å dekke kostnaden av laboratorium rekvisita, mt-dna-sekvensering, og lavere grads student lønn., Hvis vi klarer å gå utover dette målet, noen ekstra midler vil bli brukt til påfølgende innsats for å sekvens fullstendig kjernefysisk genomer (DNA arves fra både mor og far) av Nittany Løver. Gaver er skattefrie.
Områdene i det vestlige USA mountain lion (brown, fra Texas til lenger vest) og Florida panther (brown, begrenset rekkevidde i Florida), og de siste mountain lion observasjoner utenfor disse områdene på grunn av flyttinger (røde prikker). Den opprinnelige befolkningen i mountain lions i Pennsylvania og det nordøstlige USA er utdødd., Image source: National Geographic. Gå til Mountain Lion Foundation og Felidae Conservation Fund for mer informasjon om bevaring innsats for fjell-løver og andre ville katter, og Dyrelivet for Alle Begavelse Grunnlaget for informasjon om viltstell i Pennsylvania.
Vårt prosjekt plan
Som mountain lions har vært regionalt utdødd for så lenge, DNA fra våre eksempler er ansett som «ancient DNA.,»Ancient DNA er svært skjøre og kan bare gjenopprettes i bare lave mengder, og dermed krever mer sensitive teknikker enn det som er brukt med moderne DNA og et høyt spesialiserte ren lab for behandling, som vi har på Penn State.
Vi vil bruke en cutting-edge «DNA-capture» – teknikk for å målrette mountain lion mtDNA sekvenser for vår analyse. Følgende DNA-fangst, og prøvene vil bli sekvensert ved hjelp av Illumina HiSeq massivt parallelle sekvenser instrument på Penn State Huck Institutt for biovitenskap Genomics Core Laboratorium., Dette er en ganske kostbar prosess som vil ta opp mesteparten av budsjettet.
Dorman Panther, som antas å være den siste mountain lion i Sentrum County, PA frem til sin død i 1856; gjengitt med tillatelse av Økologi laboratoriet i Vitenskap Hall på Albright College.
Den Opprinnelige Nittany Lion, drept av Samuel Børste av Susquehanna Fylke i 1856; gjengitt med tillatelse fra Penn State ‘ s All Sports-Museet.,
En Pennsylvania mountain lion på displayet i Lycoming County Historical Society og Taber Museum i Williamsport, som kan ha blitt skutt nær Loyalsock Elva like nord for Williamsport.,
Vår Lab
Vi er et tverrfaglig team av forskere basert i Avdelinger for Antropologi og Biologi på Penn State University, men også for eksempel studenter med hovedfag i Biokjemi & Molekylær Biologi, Dyreliv & Fisheries Science, Økologi, Immunologi & Smittsom Sykdom, og Statistikk. Vår lab studier evolusjonær økologi og bevaring biologi, for mange ulike arter. For mer informasjon, besøk vår lab, nettside: Antropologiske Genomics Laboratorium nettstedet.,
Den gamle DNA-laboratoriet på Penn State er en dedikert rent rom anlegg hvor vi tar ut og DNA-sekvens fra skjelettrester av utdødde arter eller fra utdødde bestander av fortsatt-overlevende arter, ved å bruke samme metoder som har nylig blitt brukt til å sekvens genomet til Neandertals, mammuter og andre utdødde arter.
lab anlegg hvor den gamle DNA-arbeidet som er gjort er helt isolert fra andre DNA-forskning., Vi bruker rene rom praksis til alle tider, inkludert bruk av hele kroppen, personlig verneutstyr, og en retningsbestemt flyt av arbeid (dvs., personell reise fra ren lab til en bygning som moderne DNA-arbeidet er utført, aldri omvendt).
Pågående prosjekter i laboratoriet inkluderer genomisk analyse av forhistoriske menneskelige individer fra Amerika og er utdødd, gigantiske lemurs fra Madagaskar!, Faktisk, vi har nylig publisert en artikkel om mtDNA genom sekvenser av flere utdødd lemur arter, inkludert bestander av to arter, ved hjelp av metoder identiske med de som vi vil bruke til å sekvens Nittany Lion genomer:Publisert subfossil lemur gammelt DNA papir.
Takk skal du ha!
Vi er svært takknemlig for din interesse i våre prosjekt, og din støtte. Noen størrelse donasjon er nyttig og verdsatt! Alle personer å donere $100 eller mer vil bli invitert til å delta på et foredrag om gamle DNA-forskning på Penn State inkludert Nittany Lion-prosjekt, og til å møte våre team., Enkeltpersoner donere $500 eller mer vil også bli nevnt ved navn i erkjennelsene av vitenskapelig artikkel vi publisere basert på dette arbeidet! Disse tokenene av takknemlighet har ingen pengeverdi og påvirker ikke fradragsberettiget status på din donasjon.
Noen ekstra midler utover vårt mål vil bli brukt til påfølgende innsats for å sekvens fullstendig kjernefysisk genomer fra Nittany Løver, den neste fasen av prosjektet vårt. Den kjernefysiske genom er mye større enn det mtDNA genom og inneholder genetisk materiale arves fra både mor og far., Informasjonen fra den første fasen av prosjektet er nødvendig for å beregne budsjett for kjernefysisk genom sekvensering, men dette vil trolig koste $50 000 eller mer.
ikke glem…
Sjekk med din arbeidsgiver for å se om de samsvarer med veldedighet. Din støtte vår kampanje er en fradragsberettiget gave. Gå hit for å se om din bedrift kamper bidrag. Så, la vårt team vet kampen forhold og din donasjon beløp etter at du har fullført din donasjon, og vi vil oppdatere din gave og vår kampanje totalt.