Site Overlay

Sekventering den Nittany Lion Genom | eu-Finansieret

websitefacebook

Vores Projekt

Mountain lions (Puma concolor) var engang udbredt i hele Nordamerika, men deres sortiment skrumpet drastisk på grund af jagt med landmændene til at beskytte husdyr og habitat fragmentering. En gang almindelig i Pennsylvania har bjergløver været næsten ikke-eksisterende siden begyndelsen af 1800-tallet. den sidste dokumenterede observation af en bjergløve i Pennsylvania var i 1874., Den nordøstlige USA befolkning menes at have været regionalt uddød siden 1930 ‘ erne; den sidste registrerede observation var i Maine i 1938.

målet med vores projekt er at undersøge og analysere mitokondrie-DNA genomer af “Nittany Lions” — uddød mountain lions fra Pennsylvania og den Nordøstlige amerikas forenede stater — at bruge Gamle DNA laboratoriet ved Penn State og cutting-edge genom sekventering teknologi. Mitokondrielt DNA, eller mtDNA, er DNA arvet fra kun moderen.

vestlige USA mountain lion. Foto Venligst udlånt af Karen Arnold.,

Vi har allerede indsamlet, eller have tilladelse til at indsamle, hud prøver fra flere taxidermied mountain lions fra denne region, herunder de enkelte udstillet på Penn State Alle Sports Museum! Vi vil sekvensere mtDNA-genomet for hver enkelt person, og sammenlign derefter disse sekvenser med dem fra overlevende vestlige USA-bjergløver og Florida-pantere for at bestemme, hvordan disse forskellige populationer var relaterede.,

alt i alt håber vi de data, vi får, vil være brug for bevarelse indsats vedrørende efterlevende mountain lion befolkninger, for at øge bevidstheden om bevaring og udslettelse risiko blandt dem i Penn State community – som Nittany Lion er vores elskede maskot!, og for at fremhæve inddragelsen af bachelorstuderende i forskning på Penn State (dette projekt ledes af bachelorstuderende!).

Bruce Wright, New Brunswick wildlife biolog og forfatter, med hvad der menes at være den sidste østlige puma., Puma blev fanget af Rosarie Morin af St.achacharie, Quuebec i Somerset County, Maine i 1938. Monteret prøve bor i Ne.Bruns .ick Museum i St. John, ne. Bruns .ick (høflighed af USF .s).

sådan kan du hjælpe

du kan hjælpe os med at gennemføre dette projekt ved at donere til vores Cro .dfunding-kampagne. Vores mål er at hæve $12,000 til at dække omkostningerne ved laboratorieforsyninger, mtDNA-sekventering og lønninger til studerende., Hvis vi formår at gå ud over dette mål, vil eventuelle yderligere indsamlede midler blive anvendt til efterfølgende bestræbelser på at sekvensere komplette nukleare genomer (DNA arvet fra både mor og far) af Nittany Lions. Donationer er fradragsberettigede.

dele af det vestlige USA mountain lion (brown, fra Texas til yderligere west) og Florida panther (brown, begrænset udvalg i Florida), og de seneste mountain lion observationer uden for disse områder på grund af vandringer (røde prikker). Den oprindelige bestand af bjergløver i Pennsylvania og det nordøstlige USA er uddød., Billede kilde: National Geographic. Besøg Mountain Lion Foundation og Felidae Fonden til Bevaring for mere information om bevarelse indsats for mountain løver og andre vilde katte, og de vilde dyr for Alle Begavelse Fundament for oplysninger om bevarelse af dyrelivet i Pennsylvania.

vores projektplan

da bjergløver har været regionalt uddød så længe, betragtes DNA fra vores prøver som “gammelt DNA.,”Ancient DNA er meget skrøbeligt og kan kun genvindes i kun lave mængder, hvilket kræver mere følsomme teknikker end der bruges med moderne DNA og et højt specialiseret clean lab til behandling, som vi har hos Penn State.

vi vil bruge en banebrydende “DNA capture”-teknik til specifikt at målrette mountain lion mtDNA-sekvenser til vores Analyse. Efter DNA-indfangning vil prøverne blive sekventeret ved hjælp af Illumina Hise.massivt parallelt sekventeringsinstrument på Penn State Huck Institutes of Life Sciences Genomics Core Laboratory., Dette er en temmelig dyr proces, der vil tage størstedelen af budgettet.

Dorman Panter, og menes at være den sidste mountain lion i Centrum County, PA, indtil sin død i 1856; høflighed af Økologi lab i Science Hall på Albright College.

Den Oprindelige Nittany Lion, dræbt af Samuel Børste af Susquehanna County i 1856; høflighed af Penn State ‘ s All Sports Museum.,

En Pennsylvania mountain lion på skærmen i Lycoming County Historical Society og Taber Museum i Williamsport, der kan have været skudt tæt på Loyalsock Floden lige nord for Williamsport.,

Vores Lab

Vi er et tværfagligt team af forskere, baseret på Afdelinger for Antropologi og Biologi Penn State University, men også studerende med hovedfag i Biokemi & Molekylær Biologi, Dyreliv & Fiskeri, Videnskab, Økologi, Immunologi & Smitsomme Sygdomme, og Statistik. Vores laboratorium studerer evolutionær økologi og bevaringsbiologi for mange forskellige arter. For mere information, besøg vores lab hjemmeside: antropologisk Genomics Laboratory hjemmeside.,

De gamle DNA laboratoriet ved Penn State er en dedikeret clean room anlæg, hvor vi udtrækker og DNA-sekvens fra skelet-rester af uddøde arter eller fra uddøde bestande af stadig-overlevende arter, der bruger de samme metoder som for nylig er blevet brugt til at sekvens genomer af Neandertals, mammutter og andre uddøde arter.

laboratorieanlægget, hvor det gamle DNA-arbejde udføres, er fuldstændigt isoleret fra anden DNA-forskning., Vi bruger renrumspraksis til enhver tid, herunder brug af personlige værnemidler i hele kroppen og en retningsstrøm af arbejde (dvs.personale rejser kun fra clean lab til en bygning, hvor moderne DNA-arbejde udføres, aldrig omvendt).

igangværende projekter i laboratoriet inkluderer genomisk analyse af forhistoriske menneskelige individer fra Amerika og uddøde, gigantiske lemurer fra Madagaskar!, I virkeligheden, vi for nylig offentliggjort et papir om mtDNA genom sekvenser af flere uddøde lemur arter, herunder bestande af to arter, ved hjælp af metoder, der er identiske med dem, som vi vil bruge til at forløb Nittany Lion genomer:Udgivet subfossil lemur ancient DNA-papir.

Tak!

vi er meget taknemmelige for din interesse for vores projekt og din støtte. Enhver størrelse donation er nyttigt og værdsat! Alle personer, der donerer $ 100 eller mere, vil blive inviteret til at deltage i et foredrag om gammel DNA-forskning i Penn State, herunder Nittany Lion-projektet, og for at møde vores team., Personer, der donerer $ 500 eller mere, vil også blive nævnt ved navn i anerkendelserne af den videnskabelige artikel, vi udgiver baseret på dette arbejde! Disse tegn på påskønnelse har ingen monetær værdi og påvirker ikke den fradragsberettigede status for din donation.eventuelle yderligere midler, der hæves ud over vores mål, vil blive anvendt til efterfølgende bestræbelser på at sekvensere de komplette nukleare genomer fra Nittany Lions, Den næste fase af vores projekt. Det nukleare genom er meget større end mtDNA-genomet og indeholder genetisk materiale, der er arvet fra både mor og far., Oplysninger fra projektets første fase er nødvendige for at estimere budgettet for det nukleare genom sekventering, men det vil sandsynligvis koste $50.000 eller mere.

glem ikke…

tjek med din arbejdsgiver for at se, om de matcher velgørende giver. Din støtte til vores kampagne er en fradragsberettiget gave. Gå her for at se, om din virksomhed matcher bidrag. Derefter, fortæl vores team kampforholdet og dit donationsbeløb, når du har afsluttet din donation, og vi opdaterer din gave og vores kampagne i alt.

Skriv et svar

Din e-mailadresse vil ikke blive publiceret. Krævede felter er markeret med *