Site Overlay

Strukturel biokemi / Proteinfunktion / induceret Fit

induceret fit indikerer en kontinuerlig ændring i konformation og form af et en .ym som reaktion på substratbinding. Dette gør en .ymet katalytisk, hvilket resulterer i sænkning af aktiveringsenergibarrieren, der forårsager en stigning i den samlede reaktionshastighed. Med andre ord, når et substrat binder til et en .ym, vil det ændre en .ymets konformation. Dette danner et overgangsmedium, der sænker aktiveringsenergien og tillader reaktanterne at fortsætte mod produktet hurtigere., Proteiner) viser induceret pasform ændringerne i form af et makromolekyle som reaktion på en ligandbinding, så bindingsstedet for makromolekyle er mere effektivt i overensstemmelse med ligandformen. En .ymet vil ændre sin form, indtil det er fuldstændigt komplementært til et substrat for at aktivere en .ymet-substratkomplekset.

efterhånden som en .ymsubstratkomplekset dannes, frigøres fri energi fra dannelsen af de mange svage interaktioner mellem en .ymsubstratkomplekset., Den frie energi, der frigives, kaldes bindende energi, og den maksimeres kun, når det “korrekte” substrat binder til det tilsvarende specifikke en .ym. For at maksimere frigivelsen af fri energi skal substratet være i sin overgangstilstand. Når dette sker, bliver en .ymsubstratkomplekset en katalysator, som derefter gør andre aktiveringsenergier lavere.

enzym, det aktive site er bindende stedet for katalytiske og hæmning reaktion enzym og substrat; strukturen af det aktive site og dets kemiske egenskab er af specificitet for binding af substrat og enzym., To teorier, for de måder, hvorpå enzym, der binder sig til underlaget er lock-and-key model og induced fit model; induced fit er den model, således at strukturen af det aktive site af enzym, der let kan ændres efter bindende enzym og substrat.

En illustration af en induceret passer samspillet mellem underlag og enzymer

induced fit-modellen beskriver dannelsen af den E-S-sammensat som et resultat af samspillet mellem substrat og en fleksibel aktive site., Substratet frembringer ændringer i konformationen på en .ymet, der korrekt tilpasser grupperne i en .ymet. Det giver bedre binding og katalytiske virkninger.

denne model modsætter sig lås-og nøglemodellen, der forklarer dannelsen af E-s-komplekset som et resultat af bindingen af komplementære geometriske stive strukturer som en lås og en nøgle. Den samordnede model og den sekventielle model er modeller, der bruges til at forklare de allosteriske ændringer i konformation af et en .ym fra T-strukturen til R-strukturen og vice versa., I den samordnede model favoriserer alle underenheder, der danner den allosteriske proteinkonformation på .n gang, mens ændringen i konformation af en underenhed i den sekventielle model favoriserer ændringen i konformation af de andre underenheder.

Michaelis-Menten modellen er relateret til kinetikken af enzymet katalyserer reaktioner, og beskriver forholdet mellem koncentrationen af substrat og enzym hastighed i en reaktion antages, at ingen allosteriske effekter findes.

Adenylatkinase er et godt eksempel på induceret pasform., Dette en .ym fungerer ved let at ændre konformation, når både det nødvendige substrat, ATP og NMP er bundet. Når både ATP og nederlandenes agentur for miljøvurdering er bundet til denne kinase en del af dette enzym kaldet P-loop bevæger sig ned og danner et låg over de to grupper, på skift hjælper med at holde de to substrat tættere sammen for at lettere at udføre reaktionen af overførsel af en fosfat gruppe fra ATP til nederlandenes agentur for miljøvurdering. Dette holder fosfatgruppen af ATP tættere på NMP, dette holder også de to substrat i den rigtige orientering., Denne konformationsændring hjælper med at udføre reaktionen mere effektivt ved at placere substratet i den rigtige position og tættere på hinanden. Vi ser, at dette en .ym fungerer gennem en induceret pasform, da substratet binder konformationen af en .ymet lidt ændringer for bedre at interagere med substratet. Når Begge substratet bindes på forskellige konformationelle ændringer, der sker, dette sikrer, at reaktionen kun provenuet, når både substrat er til stede, og dette eliminerer unødvendige overførsel af en fosfat gruppe til vand, hvis de nederlandenes agentur for miljøvurdering ikke er til stede.

Skriv et svar

Din e-mailadresse vil ikke blive publiceret. Krævede felter er markeret med *